Az FC Brandenburg 03 egy német labdarúgóklub, amely Brandenburg an der Havelben található. A klubot 1903-ban alapították FC Viktoria 03 néven, és tagja a DFB Landesverband Brandenburgnak. Jelenleg a Brandenburg-Liga bajnokságban szerepel, amely a hetedik osztály a német labdarúgó-bajnokság rendszerében.

A klub Stadion am Quenz See stadionban játssza hazai mérkőzéseit, amely 10 000 férőhelyes. Az FC Brandenburg 03 színei a piros és a fekete.

A klub legnagyobb sikere az volt, hogy bejutott a DFB-Pokal második fordulójába az 1993–94-es szezonban. Ebben a körben 0-2-re kikaptak a Bundesligában szereplő Eintracht Frankfurt csapatától.

Az FC Brandenburg 03 a 2003–04-es szezonban bajnok lett a Verbandsliga Brandenburgban, és feljutott az Oberligába. Az Oberligában a klub a hetedik helyet szerezte meg a 2004–05-ös szezonban, és a 12. helyet a 2005–06-os szezonban. A 2006–07-es szezonban a klub kiesett az Oberligából.

Az FC Brandenburg 03 a 2007-08-as szezonban a Brandenburg-Liga bajnoka lett, és visszajutott az Oberligába. Az Oberligában a klub a 13. helyen végzett a 2008–09-es szezonban, és a 12. helyen a 2009–10-es szezonban. A 2010–11-es szezonban a klub ismét kiesett az Oberligából.

Az FC Brandenburg 03 a 2011–12-es szezonban a Brandenburg-Liga bajnoka lett, és visszajutott az Oberligába. Az Oberligában a klub a 10. helyen végzett a 2012–13-as szezonban, a 12. helyen a 2013–14-es szezonban, és a 10. helyen a 2014–15-ös szezonban. A 2015–16-os szezonban a klub ismét kiesett az Oberligából.

Az FC Brandenburg 03 a 2016–17-es szezonban a Brandenburg-Liga bajnoka lett, és visszajutott az Oberligába. Az Oberligában a klub a 12. helyen végzett a 2017–18-as szezonban, és a 11. helyen a 2018–19-es szezonban. A 2019–20-as szezonban a klub a 14. helyen áll az Oberligában, amikor a szezont félbeszakították a COVID-19 világjárvány miatt.