Az Omonia Nicosia U21 az Omonia Nicosia ciprusi labdarúgóklub tartalékcsapata, amely a ciprusi másodosztályban, a B' Katigoriában játszik.

Az Omonia Nicosia U21-et 1948-ban alapították, és azóta is a ciprusi labdarúgás egyik legsikeresebb tartalékcsapata. A csapat nyolc alkalommal nyerte meg a ciprusi U21-es bajnokságot, és többször is megnyerte a ciprusi U21-es kupát.

Az Omonia Nicosia U21 jelenlegi edzője Andreas Karagiannis, aki 2021 óta irányítja a csapatot. A csapat stadionja a Makarion Stadion, amely 16 000 fő befogadására alkalmas.

Az Omonia Nicosia U21-ben olyan játékosok játszottak, mint Marinos Satsias, Andreas Makris és Giorgos Efrem.