Az SC Paderborn 07 II a német SC Paderborn 07 labdarúgóklub tartalékcsapata. Hazai mérkőzéseit a Sportpark Sennelager Straße-n játssza, amely 15 000 férőhelyes. A csapat jelenleg a Regionalliga Westben játszik, amely a német labdarúgó-bajnokság negyedik szintje.

A tartalékcsapatot 2007-ben alapították, és eredetileg a Verbandsliga Westfalenben, a német labdarúgó-bajnokság hatodik szintjén játszott. 2010-ben feljutottak az Oberliga Westfalenbe, a német labdarúgó-bajnokság ötödik szintjére. 2014-ben ismét feljutottak, ezúttal a Regionalliga Westbe.

Az SC Paderborn 07 II legjobb eredménye a 2017–18-as szezonban elért ötödik hely volt a Regionalliga Westben. A csapat szerepelt a Német Kupában is, ahol a 2017–18-as szezonban a második fordulóba jutott.

Az SC Paderborn 07 II jelenlegi edzője Markus Krösche.

A csapat híres akadémiájáról ismert, amely számos tehetséges játékost adott a német labdarúgásnak, köztük Mario Götze és Julian Draxler.