A Paksi FC jelenleg a magyar labdarúgó-bajnokság első osztályában szerepel. Első szezonja az NB I-ben, a 2006–07-es volt. Azóta rendszeres tagjai a bajnokságnak. A csapat legnagyobb sikere, hogy 2011-ben megnyerte a Ligakupát, valamint a 2010–11 NB I-es bajnokságban ezüstérmes lett.